脑积水的手术目前为止只有两种方案，即脑室腹腔分流，其适合各种类型的脑积水和各年龄段；以及三脑室底或者中板造瘘。

在1岁以内的新生儿、婴幼儿的脑积水病例中，造瘘的成功率在20%-30%，所以一般选择1岁以内的小儿脑积水使用脾胃分流的方式，脾胃分流手术涉及到颅腔和腹腔，即把脑脊液从脑室经皮下隧道到腹腔。医院做这种手术一般情况是40-50分钟。如果造瘘，一般1岁以上的小孩才做造瘘手术，一般手术时间在1-1.5小时之间。