真菌性角膜炎在生活当中不是太常见，发生这种情况的病例比较少，但是它一旦发生，治疗很不容易彻底。真菌性角膜炎容易引起很多并发症：
1、常见的是真菌性引起的角膜穿孔，因为真菌性角膜炎导致角膜周围组织交易性破坏，会引起角膜穿孔；
2、真菌性角膜炎的病情会向深部组织发展，侵犯到色素膜，就是眼睛里面黑色的东西，即虹膜，会引起虹膜睫状体炎，导致看东西看不清楚、疼痛等；
3、再往里面进一步发展引起真菌性眼内炎，引起眼球的疼痛，甚至眼球可能保不住；
4、继发青光眼：真菌性角膜炎患者的复合物容易在前房堆积，使眼压增高，引起继发性青光眼，青光眼是致盲的常见病之一。