服用72小时紧急避孕药，仍然有可能发生意外妊娠，即便在医生指导下正确服用，依然有5%的避孕失败可能性。如应用紧急避孕药后出现避孕失败，导致意外妊娠，可能给女性的身心健康带来极大危害。此外，服用不同类型的紧急避孕药，可能会产生不同的副作用，如恶心、呕吐，以及阴道异常出血等，可能给女性带来较多困扰。所以对于普通女性，从妇科专科医生的角度，不提倡应用该种紧急避孕方法，来达到避孕目的。
一般提倡应用对身体危害性更小的常规避孕方法，如应用口服短效避孕药，正确服用后可抑制排卵，达到较好的避孕效果。此外也可应用避孕环、宫内节育器等，均可达到长时间避孕的目的，也可使用男用避孕套等方式进行避孕。只有对性生活过程中未采取保护措施，或性生活过程中出现纰漏，如避孕套破裂等情况，才能够应用紧急避孕药，来尽量降低妊娠可能性。
