膀胱结石的病因多认为与营养及继发感染、梗阻等因素有关系：

1、下尿路梗阻：在膀胱结石病因中最常见，当有下尿路梗阻时，如尿道狭窄、尿道先天畸形、前列腺增生、膀胱肿瘤等，均可使小结石和尿盐结晶沉积于膀胱而形成结石；

2、高动物蛋白摄入可致尿液中钙和草酸的含量增多，尿pH值下降，促使结石形成。糖分摄入过多可促进肠道吸收钙和草酸，导致尿钙排泄增加。蔬菜和食物纤维摄人过少，易发生结石。另外，维生素族、矿物质、盐类的摄入或代谢异常，也会增加尿石形成的机会；

3、膀胱异物：膀胱异物如导管、缝线等可作为核心，使尿盐沉积于周围而形成结石；

4、感染：继发于下尿路梗阻和膀胱异物的感染，特别是能够分解尿素的细菌感染，使尿pH值升高，磷酸钙、铵和镁盐沉着而形成结石。代谢性疾病，如胱氨酸尿症、草酸钙、磷代谢异常等也易导致结石形成；

5、其他：血吸虫病的虫卵在膀胱内作为核心而形成的结石，还有肿瘤表面变性、坏死、钙化可继发膀胱结石的形成。