川崎病的病因尚未完全明确，但是流行病学和临床表现显示，可能与感染有关，呈流行性、地方性，临床上存在的病因有以下几个方面：

1、感染学说：一般认为它与多种病原感染有关，比如溶血性链球菌、EB病毒等感染；

2、变态反应学说：认为本病可能是宿主对感染原的一种异常的反应，可以由细菌、病毒、寄生虫等抗原刺激机体引起；

3、药物学说：抗生素、磺胺药、异烟肼、水杨酸类以及苯巴比妥类药物可能引起川崎病。