正常阴道菌群以乳杆菌占有优势，若产生过氧化氢的乳杆菌减少，阴道的pH值升高，阴道微生态失衡，其它微生物大量繁殖，主要有加德纳菌，还有其它厌氧菌的感染，导致细菌性阴道病。促使阴道菌群发生变化的原因仍不清楚，可能与下列因素有关，具体如下：

1、间接接触传染：如患者曾经接触过其他患者感染的公厕坐便器、浴盆、浴池、座椅、毛巾等，可能会感染细菌性阴道病；

2、性伴侣的传染：经临床研究发现，有细菌性阴道病的患者，其性伴侣约有10%存在细菌性尿道炎，因此在治疗时应对两者进行共同治疗，以防交叉感染；

3、抗生素服用过量：若抗生素服用过量，可对阴道的微生物环境造成破坏，致使致病的细菌病原体在阴道繁殖，进而导致局部细菌性阴道病的发作；

4、反复的阴道灌洗：部分女性会经常用药冲洗阴道，造成阴道的酸碱环境破坏，降低阴道的抵抗力，进而感染细菌性阴道病的几率就会增加。