功能性腹痛综合征首先要详细询问患者病史，有无手术史、精神创伤史、外伤史等，同时了解患者有无精神病家族史、患者家庭及本人文化素质、有无心理异常及其他的原因等。再仔细进行腹部检查及辅助检查，具体的检查方法如下：

1、腹部检查：功能性腹痛综合征患者可能有多处腹部压痛或广泛压痛，甚至有肌抵抗，但当其注意力分散后，肌抵抗可减轻或消失。当患者仰卧位存在腹壁触痛时，若抬头、抬躯干或下肢使腹肌变紧，也可引起类似的腹壁触痛或使触痛加重；

2、器械或实验室检查：辅助检查均无阳性反应，包括全消化道钡餐透视、内镜、腹腔镜、超声、CT、磁共振、血管造影等均为阴性，实验室检查无异常。