传染性软疣极易复发。传染性软疣的复发的原因有多种因素，具体如下：

1、患者的免疫功能下降，尤其是细胞免疫功能下降是复发的主要原因；

2、在治疗传染性软疣时，没有有效的清除残余的皮疹；

3、原有的皮疹周围已经有亚临床感染症状，肉眼不能辨别的情况下，经过一段时间后就会发展成疣；

4、夫妻双方交叉感染也可能会引发病情的反复；

5、因搔抓或者个人卫生不良从而引起的自身接种等等。

部分患者发病几个月以后，皮损可以发生斑片状湿疹样的改变，跟眼睛周围有皮炎时，甚至可以引发慢性结膜炎及浅表性的点状角膜炎。