下肢肌间静脉血栓的治疗方法，主要根据病人的实际情况进行选择。具体情况如下：

1、下肢活动正常：如果病人下肢活动没有任何障碍，可以给予非甾体类抗炎药，以及静脉活性药物，比如黄酮类的静脉活性药物，来促进下肢静脉血液循环，减轻下肢肌间静脉血栓引起的腿部疼痛不适症状；

2、卧床或下肢活动不利：如果病人处于卧床或者是下肢活动不利的状态下，除了非甾体类抗炎药、静脉活性药物之外，还需要应用抗凝的药物，这样能够避免血栓进一步发展。因为如果病人下床活动非常顺利，活动本身就是预防血栓的物理方式。如果是长期卧床或者是行动不便的病人，没有运动这种物理预防方式，就需要应用药物的预防，比如新型的口服抗凝药或者是传统的抗凝药。目的就是避免下肢肌间静脉血栓进一步发展，避免长到深静脉，也避免血栓的脱落而引起肺动脉栓塞。