手足口病患儿自然病程是1-2周，即多数患儿在1-2周内疾病可恢复。小儿手足口病是病毒感染导致的疾病，针对病毒无需使用抗病毒药和抗生素，只需等待自然病程即可。轻症患儿除发热和皮疹之外，通常无特别严重的表现，无需特别用药，自然病程多数在1周，皮疹消退时间不超过2周。

如果患儿出现明显发热，可使用退烧药，比如布洛芬或对乙酰氨基酚，通常发热会维持3-5天，绝大部分不会超过1周，只要患儿不再发烧即可停药。患儿出现皮疹通常是不疼、不痒、不结痂、不留疤，因此针对皮疹无需任何特别处理，只需要等待自行消退即可。