柠檬蜂蜜水，不建议用于有酸相关性疾病的病人，即反流性食管炎、慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡。因为柠檬蜂蜜水，属于酸性食物，摄入后会加重酸分泌增多。胃酸分泌增多，会加重反流性食管炎、慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡症状，如出现腹痛、反酸、嗳气等。另外，不建议用于有腹泻的情况，如炎症性肠病或非特异性肠炎等。因为柠檬蜂蜜水可以刺激胃肠蠕动，同时可以润滑肠道，加重腹泻症状。

柠檬蜂蜜水，可以用于有便秘的情况。如果有大便干结或便秘，饮用柠檬蜂蜜水后，可以帮助缓解便秘，或预防便秘出现。此外，醉酒时可饮用柠檬蜂蜜水，柠檬含有丰富的维生素C，蜂蜜水含有多种酶，可以加速酒精代谢，起到加速作用，便会降低酒精对人体的伤害。