目前研究资料表明，头孢克肟主要不良反应包括腹泻等消化道反应，占0.87%；皮疹等皮肤症状占0.23%；临床检查值异常，包括GPT(谷丙转氨酶)升高，占0.61%；GOT(谷草转氨酶)升高占0.45%；嗜酸性粒细胞增多占0.2%，具体副作用如下：

1、休克，由于有引起休克的可能，应密切观察；若患者口内异常感，出现哮喘、眩晕、便意、耳鸣、出汗等现象，应停止给药，采取适当处置；

2、过敏样症状，如出现过敏样症状，包括呼吸困难、全身潮红、血管性水肿，荨麻疹等，应密切观察；

3、皮肤病变，如有发生皮肤黏膜炎症候群、中毒性表皮坏死症可能，应密切观察；如发生发热、头痛、关节痛，以及皮肤或黏膜红斑、水疱，皮肤紧张感、灼热感、疼痛等症状，应停止给药，采取适当处置措施；

4、血液障碍，有发生粒细胞缺乏症、溶血性贫血、血小板减少的可能，因此应密切观察，进行定期检查等；

5、肾功能障碍，由于有引起急性肾功能不全等严重肾功能障碍可能，因此应密切观察，例如进行定期检查等，有异常发生时应停止给药，采取适当处置；

6、结肠炎，可能引起有血便的严重大肠炎，例如伪膜性结肠炎；

7、有出现伴有发热、咳嗽、呼吸困难、胸部X线异常、嗜酸性粒细胞增多等症状的间质性肺炎，以及PIE症候群的可能。