悬雍垂乳头状瘤的病因通常并不明确，一般认为其发生一方面跟遗传因素有关，另一方面可能和病毒感染、慢性炎症刺激等多种因素有关。

1、遗传因素：悬雍垂乳头状瘤和遗传因素具有一定的关联。如果家族中有乳头状瘤的病人，这个家族中的其他成员，特别是血缘关系比较近的成员，发生乳头状瘤的机会会明显增加；

2、病毒感染因素：很多研究认为悬雍垂乳头状瘤的发生，和人乳头状瘤的病毒感染有一定关联。甚至有研究发现，如果胎儿出生的时候吞入了母亲的羊水，而母亲患有妇科的乳头状瘤病毒感染，则可能会传染给子女，从而在出生之后发生悬雍垂部位的乳头状瘤或者食管的乳头状瘤；

3、慢性炎症刺激：如果悬雍垂部位经常出现慢性炎症，由于慢性炎症的影响，局部可以形成乳头状瘤。

一旦发现悬雍垂乳头状瘤，应该积极进行手术切除，避免发生癌变。