胃肠道是空腔脏器，所以彩超检查诊断疾病的效果可能较差，尤其是针对消化系统的溃疡、肿瘤等疾病，其诊断方法还是需要以内窥镜检查为主。但是胃肠道彩超也可以帮助诊断部分疾病，比如胃肠道穿孔、急性胃扩张、幽门梗阻、肠梗阻、肠套叠等；针对部分胃肠道方面的炎症类疾病，比如肠系膜淋巴结炎、慢性胃炎、还有急性阑尾炎，也同样具有一定的诊断价值。