胆囊炎主要的病因包括两大类：第一类是由胆囊本身的因素，另一类是非胆囊的因素。

非胆囊因素主要是胆管的因素，比如胆管结石梗阻引起胆囊炎，胆囊本身的因素主要是胆囊结石梗阻。以上两方面都是因为管道不通畅、梗阻而导致胆囊内的胆汁淤积，引起细菌滋生，从而导致炎症的发作。

在广东或者珠三角地区，还有一个特别的病因，即为肝吸虫病，因为该地区的人群喜欢吃鱼生。

此外，寄生虫感染，比如胆道蛔虫也是容易引起胆囊炎的一个病因。其它例如免疫系统的疾病，现在比较少见，最主要的是结石和寄生虫梗阻。