根据咽峡炎的分类不同，造成的疾病的病因不同，临床表现也不同，具体表现在以下几点：

1、疱疹性咽峡炎：由柯萨奇病毒以及埃可病毒、肠道病毒引起。疱疹性咽峡炎患者以及隐匿性感染者是本病的主要传染源。传播方式包括直接经肠道传播、呼吸道传播以及间接经污染的食物、衣物、用具等传播。各年龄段人群均可以受到感染，但是以3-10岁多发；

2、樊尚咽峡炎：由常隐藏在健康人群扁桃体隐窝中的梭形杆菌，以及樊尚螺旋体感染所致。当存在过度疲劳、营养不良、口腔不洁等可以造成机体抵抗力下降等诱因时，可以诱发本病。但也可以因直接接触或者食用受污染的食物而感染。