月经期间可以在医生指导下吃氟康唑。氟康唑是治疗真菌感染的广谱抗生素，主要用于治疗口咽部和食道的念珠菌感染以及播散性念珠菌病，包括念珠菌引起的腹膜炎、肺炎、尿路感染，以及念珠菌引起的霉菌性阴道炎，也用于骨髓移植患者，接受细胞毒类药物或者放射治疗时，预防真菌感染的发生，临床上使用范围比较广泛。

氟康唑是一种抗生素，可能会引发消化道呕吐、恶心等不良反应，也可以出现皮疹等过敏性反应，长期应用甚至可以导致一过性血清转氨酶升高，但是它不会引起内分泌环境改变，也不会影响月经周期和月经量。患者在月经期间，体内发生感染性疾病，如果明确是真菌感染，需要应用抗真菌药物，可以在医生指导下吃氟康唑。