早晨起来手指关节疼痛，可能以下疾病导致：

1、类风湿性关节炎：侵犯小关节的对称性、炎症性疾病，主要表现晨僵与手指关节疼痛，晨僵时间通常1小时以上。实验室检查可以发现类风湿因子阳性，有关抗体，如抗CCP抗体、抗角蛋白抗体、抗核周因子等出现阳性；

2、骨性关节炎：属于退行性病变，可以有骨质增生；

3、自身免疫病：如系统性红斑狼疮、干燥综合征、皮肌炎、多发性肌炎、硬皮病等；

4、脊柱关节炎：表现为周围关节疼痛，包括手指关节疼痛。

患者需要及时到医院进行诊治，做相应检查明确诊断。