儿童发育迟缓的治疗依据病因。甲状腺功能低下等代谢性疾病可用药物治疗。如甲低者给予补充甲状腺素片，甲基丙二酸血症者补充维生素B12，苯丙酮尿症的患儿用低苯丙氨酸食物治疗。若未查到病因者应排除有无损伤大脑的继发因素如癫痫，除外这些因素后可应用营养大脑的药物促进大脑发育。也可做针对性的康复训练，做测评可看出哪方面问题比较大，如认知能区、适应性能区是智力的核心能区，往往需要重点关注。