无论胆囊结石需要行腹腔镜胆囊切除，还是开腹胆囊切除，都有发生并发症的可能性。通常胆囊切除采取的金标准是腹腔镜胆囊切除术，少数患者需要中转开腹胆囊切除术。最严重的并发症为手术过程中由于炎症、解剖结构异常或者其它因素导致辨别管道困难，胆总管损伤或者肝动脉损伤，术后出现胆瘘或者胆管狭窄，即医源性胆管损伤。

医源性胆管损伤发生率很低，只有0.1%左右，但是处理较为棘手，会导致严重后果。因此，一旦发生这类并发症，要尽快转到专业肝胆中心进行治疗。此外，胆瘘、胆囊床出血都是胆囊结石术后常见的并发症，包括腹腔镜或者开放手术切口感染、切口出血。