小孩子肚脐眼上面疼痛原因包括肠系膜淋巴结炎及胃部不适，具体如下：

1、肠系膜淋巴结炎：间断性疼痛，有时候痛有时不痛，就医进行B超检查提示肠系膜淋巴结肿大。如果淋巴结肿大不是特别严重，可以先清淡饮食，海鲜、鸡蛋、葱、姜、蒜等尽量少吃，避免诱发肠系膜淋巴结增大；

2、胃痛：中国人餐饮不是分食制，是全家在一起吃饭，如果大人有幽门螺杆菌感染，通过聚餐小孩子也会有幽门螺杆菌感染，导致胃炎即可出现上腹部疼痛或肚脐以上疼痛。建议就医进行呼气试验，大人可以进行呼气试验，发现幽门螺杆菌感染，需找内科医生进行杀菌，一般多使用三联抗菌药物治疗，此外需全家一起治疗。