生理性卵巢囊肿是指随着月经周期更替，可以自行消失的囊肿。生理性卵巢囊肿一般为壁薄、单侧，直径在5cm以下的囊肿，但也存在直径8cm的囊肿。一般观察或者口服避孕药2-3个周期就会自行消失，不会对身体产生影响，只要定期复查B超即可。
临床上较多女性通过辅助检查B超，发现右侧卵巢有2.3cm的囊性块，有些B超医生直接将其定为囊肿，有些定为囊性块，患者多较为紧张，会到门诊咨询医生是否为肿瘤，是否需进行手术。遇到这种情况，其可能为生理性囊肿，大可不必紧张，2个月后再次就诊。在月经第5天复查B超多可消失，如果不消失，也可以口服避孕药2-3个月以后再复查。如果其持续存在，卵巢囊肿则会影响卵巢功能，所以有时也会进行药物治疗。
