腹腔热灌注化疗顾名思义一个是热，另一个是化疗。副作用有以下几点：
1、化疗药副作用：如消化道反应，恶心、呕吐、食欲不振。另外，会有肝肾功能损害、心脏毒性，对心功能亦会产生影响等。还有脱发，这些皆是化疗药物副作用；
2、热的副作用：热灌注化疗还有个副作用即热，因温度需加热到41-42℃之间，人体正常体温是37℃，超过37℃属于发烧，而此液体需加热到42℃左右。此情况下在人体内循环半个小时，人基础体温会迅速上升，会给病人造成一定影响，这也是热损伤的副作用。
这两种结合在一起，病人在此种治疗之后，即会有各自不同副作用。有些如热产生副作用，在治疗过程中给病人头部降温，这样在治疗中能保证病人大脑不会因热温度上升太快，而对脑有损伤，同时也起到降低基础体温的目的。
