一般情况下，淋巴结结核分为表浅的淋巴结结核，包括颈部、腋下等部位的淋巴结结核。常规的表浅的淋巴结结核手术之后会留下疤痕。手术过程中出现神经损伤时，相应部位会出现皮肤麻木、不正常的疼痛或疤痕收缩等比较常见的后遗症。

深部淋巴结结核更为复杂，深部的淋巴结结核包括心脏周围、腹腔等部位的淋巴结结核，手术时损伤性比较大，并发症或后遗症与其它疾病手术出现的并发症相似，主要为局部疼痛、形成刀口疤痕等。