甲胎蛋白诊断肝癌的灵敏度和特异性都非常好，该指标可对肝癌起到很好的诊断价值。甲状腺蛋白的正常值是0-9ng/mL，但每个实验室的试剂或者检测方法不同，上述正常值也会略有差异。
若甲胎蛋白明显增高，如＞400ng/mL的时候就要高度怀疑肝癌的诊断。若甲胎蛋白增高在100-200ng/mL或持续增高的情况下，则可能是代表肝损伤此时肝在增殖修复的过程。因此，要定期监测甲胎蛋白。
此外，病毒性肝炎的患者持续肝损伤时，甲胎蛋白也会增高。此时则要监测两个指标，一个是甲胎蛋白，另一个是谷丙转氨酶。
若上述两个指标同时上升，则考虑是肝脏炎症的改变。若上述指标分离，即甲胎蛋白持续增高，而谷丙转氨酶正常，此时也要高度怀疑肝癌的诊断。
但需要注意甲胎蛋白除了诊断肝癌外，女性妊娠或生殖腺胚胎瘤也可导致甲胎蛋白增高。
