莫匹罗星软膏可以应用于包皮龟头炎的治疗，莫匹罗星软膏是抗菌素，主要针对常见的细菌感染，通常是局部外用。在包皮龟头炎的治疗当中，适用于由细菌感染引起的包皮龟头炎。包皮龟头炎是包皮和龟头之间的弥漫性炎症，通常由感染性和非感染性的致病因素组成，具体因素分析如下：

1、非感染性因素：主要见于个人观念卫生差或青少年，主要是由包皮垢刺激引起；

2、感染性性因素：包皮龟头炎是各种病原微生物感染所造成，比较常见的感染微生物包括白色念珠菌、支原体、衣原体、滴虫以及各种细菌。

无论是何种类型的包皮龟头炎，治疗的原则通常都是抗菌消炎、内外兼治。对于细菌感染引起的包皮龟头炎，治疗上首先口服抗生素，其次就是局部外用药物，通常推荐的药物是雷夫诺尔溶液、硼酸水等清洗局部，而莫匹罗星软膏作为抗生素，也有一定的杀菌、抑菌作用，也可以用于包皮龟头炎的外部治疗。