新生儿支气管炎的治疗一般遵循新生儿肺炎治疗原则，无特殊情况，建议住院治疗。部分家长不愿新生儿住院，选择口服抗生素治疗，但因新生儿口服抗生素吸收较差，可导致病情的延误甚至加重病情进展，引起新生儿呼吸困难加重甚至发生呼吸衰竭。

另外，患支气管炎的新生儿常可出现气道痰阻、分泌物增多，严重时可导致窒息、缺氧、呼吸及心跳骤停甚至危及生命。