外界微生物对人体致病几大病原体里，其中就有衣原体和支原体，比较熟悉的最常见的是细菌、病毒。此外还有支原体、衣原体，以及真菌、螺旋体、立克次体等病原体。衣原体和支原体也是微生物，引起人体感染和细菌、病毒一样，即支原体感染和衣原体感染。

引起不同部位的具体病变不一样，比如支原体肺炎、衣原体结膜炎，支原体阴道炎等。衣原体有几种，如衣原体的鹦鹉热等等，只是病原体引起人类感染的一种疾病而已。衣原体感染和支原体感染都是一种疾病，与其它没有直接关系。