肠镜也叫电子结肠镜，是通过肠镜由肛门进入肠道内对全大肠进行黏膜面的仔细观察的一种方法。肠镜作为一种异物，进入人体内后，会引起患者的不适，所以很多患者会自觉做肠镜时腹痛，肠镜对于肠子黏膜具有一定的压迫作用，但是这种损伤是微不足道的。

当肠道存在严重的疾病，粘连角度过大时，肠镜通过扭曲的肠腔，有可能加重黏膜面的损伤，部分患者甚至会出现穿孔。做肠镜时如果发现肠黏膜表面有病变，会使用活检钳钳取一部分组织来进行活检，这种情况下部分患者会出现出血。上述两种损伤就是肠镜对肠子的损伤，但是这种损伤对于大部分患者都微不足道，肠镜整体来说是安全的，尤其是在三级甲等医院经验丰富的医生手中。