先需区分先天性色素痣的病变范围和病变性质，先天性色素痣可分成小型痣、中型痣和巨痣。如果先天性色素痣的范围较小，在5mm以下，可以考虑对先天性色素痣用激光或者冷冻的方法治疗。如果范围增大，比如是中等范围的色素痣或巨痣等先天性色素痣，患者必须考虑手术切除。如果范围比较局限，可以对痣进行切除后直接缝合。

如果色素痣的范围较大，比如巨痣则考虑将色素痣切除后，再局部应用植皮和扩张器等方法，以取得比较满意的效果。