双肾结石如果治疗最好，应根据双侧肾结石的具体情况，采取不同的方法治疗：

一、单发肾结石：

1、保守治疗：如结石直径在5-6mm，较好的治疗方法是保守治疗。常见的方法有多饮水、大量运动，结石一般可自行排出体外。如果结石直径较大，在6mm-1cm，通过保守方法无法排出，还可以借助于药物，常见药物包括排石颗粒、排石汤剂，还有α受体阻滞剂如坦索罗辛、多沙唑嗪等；

2、体外冲击碎石：如果结石直径在1-2cm，可以采取体外冲击波碎石，对于单发结石，体外冲击波碎石效果较好。
二、多发肾结石：

如果结石直径在1-2cm，同时伴有多发结石，经尿道输尿管软镜取石是较好的治疗方法。如果结石体积更大，在2cm以上，且是多发结石，治疗上可采取经皮肾镜。如果是进行双侧肾脏经皮肾镜取石，建议先取容易的一侧，因相对易取出且较安全，择期再碎另外一侧结石。