肾结石的碎石不会导致肾衰竭。体外冲击波碎石属于有创的治疗，要求同一个部位，不能够连续碎石3次。以肾结石为例，冲击波能量特点是遇硬则强，即能量传递过来，对硬的石头损伤、粉末化的能量会最强，但石头周围被肾脏所包绕，对肾脏只是损伤小而已，但并非对肾脏没有损伤。

如肾脏本身不健康，如患有慢性的肾病、肾炎等状况，体外冲击波碎石甚至可能导致肾脏的破裂，但非常少见，可不用再担心。主要可能会造成血肿，包括在碎石后由于感染性结石会粉末碎开，内部细菌也会显露出来，导致极少部分的患者在碎石后出现感染、发热等状况。