小孩打完手足口疫苗，可能会有消化道症状，如出现恶心、呕吐，或者伴有发热症状，一般发热＜38.5℃，相对一般状态较好，持续1-2天后，不需要特殊治疗就会缓解。
还有部分小孩打完手足口疫苗，局部的针眼部分可能出现红肿或痒感，这种也属于正常的不良反应。还有部分小孩打完手足口疫苗后，可能会出现一过性的肠道腹泻，都是因为手足口病毒进行处理后，打入人体产生的免疫反应。
打疫苗主要是对病原微生物进行处理，通常是针对的EV71，经过处理后，将其病原性去除，作为抗原打入人体，从而引起免疫系统的反应，产生抗体。在以后遇到真正的病毒时，从而起到预防疾病的作用。
小孩在有必要时，还是可以打手足口疫苗。打完后虽然会有部分不良反应，但多数小孩不需要特殊治疗，1-2天后会缓解。若长时间不缓解，应该及时到医院就诊，明确产生的原因是疫苗反应或本身出现疾病状态。
