治疗腋臭挂哪个科室要根据每个医院的具体情况而定，可以开展腋臭手术的有普外科、整形外科、烧伤整形科和皮肤外科等，建议在医院的导医处进行咨询。

相对于挂哪个科室，更重要的是找专业领域的医生，比如有些整形医生更加专注于毛发、眼鼻，有些普外科医生可能更专注于甲状腺、乳腺，或更专注于整形和修复，所以最好的方式是在医院的导医处进行咨询。