脚趾甲上有裂缝原因比较多，具体如下：

1、全身性的慢性疾病：如营养不良、维生素或微量元素缺乏等，影响脚趾甲根部甲母质细胞功能，进而可以导致甲板出现各种异常，包括裂缝；

2、急性感染性疾病：也可以导致脚趾甲甲母质细胞功能一过性障碍，会在趾甲上留下印记，包括裂缝，可以通过相关检查明确；

3、脚趾甲局部因素：局部有皮肤癣菌等真菌感染，可以通过角蛋白酶破坏甲板结构，导致甲板出现裂缝。如果脚趾甲受外伤，也可以导致甲板受损出现裂缝。