金黄色葡萄球菌属于革兰氏阳性球菌，对于此类细菌治疗的药物种类较多。患者可以选择青霉素类抗生素、一代头孢、二代头孢以及红霉素、林可霉素、克林霉素等对革兰氏阳性球菌敏感的抗生素，疗效均较为理想。但金黄色葡萄球菌出现耐药的比例在逐渐升高，此时常用的青霉素类抗生素以及头孢类抗生素的治疗效果可能不佳。

若怀疑为金黄色葡萄球菌的耐药菌引起的感染，需选择万古霉素或利奈唑胺等更敏感的抗生素，才能达到较好的治疗效果。另外，根据细菌培养加药敏试验选择敏感的抗生素较为合理，可以取得更好的临床治疗效果。