新生儿的先天性腭裂通常在新生儿期间不予特殊处理，可以预防反流造成的并发症，如误吸导致吸入性肺炎，或者鼻腔反流导致中耳炎。通常等患儿到2岁左右时，可以进行手术整复治疗。

此时患儿体重达到一定程度，手术风险降低。而且此时患儿处于学说话的开始阶段，对将来语音形成、构音习惯影响较小。