患者出现大拇指指甲凹陷的原因需根据凹陷方向进行判断，常见于以下情况：

1、横行凹陷：通常将指甲部位的横行凹陷称为横沟，主要与轻度外伤或甲母质炎症有关，当患者有手部湿疹或银屑病时均可引起甲周炎症并导致甲横沟；

2、纵行凹陷：指沿指甲近端至远端而出现的凹坑，通常与疾病因素有关。患者需考虑是否有黏液囊肿、血管球瘤、化脓性肉芽肿或纤维角皮瘤等局部肿物增生，患者需到医院进行超声检查或核磁检查，以明确是否有局部肿物。

因此，横行与纵行凹陷有所区别，需要进行鉴别。