新生儿的先天性心脏病有不同类型，对于室间隔完整性大脉转位，或部分合并比较小的室间隔缺损，需要早期手术，即在新生儿期手术。新生儿期手术术后恢复基本上和正常成人无区别，但要注意新吻合口是否会出现反流、是否出现再狭窄。

对于比较大的室间隔缺损，早期肺血比较多，肺炎较重，甚至会引起呼吸衰竭，要在新生儿期做手术。对于单纯室间隔缺损，新生儿期做手术，1-2个月恢复后和正常孩子无区别。