若阴茎已经发生萎缩，患者难以通过服用药物使阴茎体积恢复。此时建议患者服用西地那非或他达拉非等PDE5抑制剂，通过改善阴茎供血以改善勃起，可在一定程度上恢复阴茎的功能。阴茎萎缩发生可能会导致阴茎体积缩小，而当阴茎体积缩小后则难以通过药物使阴茎的体积再次恢复。此时若患者想要恢复阴茎的长度或周径，可以开展阴茎延长手术或阴茎增粗手术以实现阴茎外观整形的效果。
若患者想先通过药物适当改善，可以考虑服用PDE5抑制剂，常用的药物包括他达拉非、西地那非，可改善阴茎的勃起功能。上述药物可能无法将阴茎已经缩短的长度恢复，但可以通过改善阴茎的勃起给予阴茎更多血流灌注，保存剩余的阴茎组织功能以实现更好的勃起。在此过程中也可以避免阴茎萎缩进一步加重，并且阴茎的充分勃起对于阴茎功能的好转以及阴茎外观均存在一定的好处。
