一般宫内膜异位症无法自愈。子宫内膜异位症一旦发生，对于育龄期女性，特别年轻女性容易进展，因雌激素长期作用、月经不断来潮、子宫内膜剥脱，通常子宫内膜异位症会有进展。

在特殊情况下，妊娠期对子宫内膜异位症存在天然治疗作用，部分女性在妊娠及分娩后，痛经较原来减轻，属于假孕疗法，对于较轻的子宫内膜异位症存在一定治疗作用。但是子宫内膜异位症无法自愈，一旦发生基本呈进展状态，可采用部分措施减缓进展，如药物、针剂甚至手术治疗。