功能性胃肠病的治疗需遵循综合治疗、个体化治疗的原则，常见如下：

1、保持良好心态：患者需保持良好心态，调整情绪，避免过度紧张、焦虑等不良情绪对疾病造成影响，同时注意改善睡眠；

2、养成良好生活习惯：应摄入清淡、易消化的食物，避免每餐进食过饱，在餐后不宜立刻剧烈活动或久坐、躺卧；

3、锻炼身体：患者需加强锻炼以增强身体素质，每天适当运动30分钟左右，可进行有氧运动以保持活力；

4、药物治疗：若症状未见好转，患者可以使用药物进行对症治疗，如动力障碍的患者需应用促动力药，腹泻、腹部不适的患者可以应用微生态制剂。若患者出现焦虑或抑郁，可以给予神经递质调节药以改善相关症状，还可以应用调节睡眠的药物以改善睡眠欠佳症状，控制疾病。