卵巢囊肿一旦发生疼痛，有两种情况，处理方法如下：

1、卵巢囊肿发生蒂扭转：蒂扭转之后因为动脉血可以进入囊肿里，而静脉血不能回流，导致囊肿急速增大，称为卵巢囊肿蒂扭转，这种需要紧急到医院进行手术治疗；

2、卵巢囊肿破裂：卵巢囊肿破裂最多见于巧克力囊肿破裂，如果是其它囊肿的自发性破裂，要排除恶性可能，对这两种情况都建议及时到医院进行手术治疗。

正常情况下卵巢囊肿不会有疼痛感觉，很多女性朋友大多是在晨起时自己摸腹部，下腹部发现包块，然后到医院就诊，经过彩超发现卵巢囊肿。一旦出现卵巢囊肿疼痛，应当及时就诊。