非淋性尿道炎一般吃抗生素是最好的治疗方法，常用的抗生素有美满霉素(盐酸米诺环素)、阿奇霉素、氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星等，都对于非淋有比较好的治疗效果，但是要在医生指导下使用。
首先要检查尿常规，看尿里的白细胞的数量，如果白细胞数量很多，尿痛、尿频的症状比较严重，可以选择一些效果更强的抗生素，如美满霉素、阿奇霉素等。如果白细胞不是很多，可以选择氧氟沙星等抗生素，服药疗程是1-2周。
当临床症状得到控制，尿里面的白细胞完全消失，才认为是治愈了。所以非淋的治疗也要注意药物的剂量和疗程，尽可能将其治愈。如果长期不治愈可能会转为慢性，导致上述症状反复出现，不容易治好。
非淋跟不洁的性生活有一定关系，所以要注意性生活的卫生，尤其男性要避免不洁的性接触，在公共场所尽量避免使用公用的浴巾、浴盆等。
平时注意多喝水、多排尿，治疗期间不要喝酒，治好以后尽量少喝酒，尤其不要喝大酒。因为喝酒会降低尿道的抵抗力，可能会导致尿道炎的复发。
