脊髓脊膜膨出手术后20年，患者可能仍然会有一些后遗症。因为脊髓脊膜膨出是比较严重的神经管闭合不全畸形，患者常有不同程度的双下肢运动感觉障碍，可以表现为肌肉萎缩、肌力下降，甚至一侧乃至两侧肢体瘫痪，同时伴有疼痛、麻木等感觉障碍，以及排便、排尿等功能障碍。严重的患者可能会长期遗留尿失禁、大便失禁，或者便秘、排尿困难等情况。
还可能会有皮肤营养不良性的溃疡、下肢关节畸形、皮肤褥疮等情况。另外一些患者可能会出现皮肤局部瘢痕，以及脊髓脊膜膨出、原来手术修补部位发生再次粘连，和再次脊髓栓系的情况。如果脊髓发生再次栓系，原有的症状可能会进行性加重，必要时需要进行再次的神经影像学检查和临床评估，有时还需要考虑进行再次手术治疗。
