患者通过飞秒激光进行角膜切削，以治疗近视手术的常见后遗症主要如下：

1、干眼症：50%的患者在术后1个月内有干眼症，20%的患者在术后3个月之内有干眼症，个别患者持续存在干眼症。干眼症发生的主要原因是角膜上皮损伤，以及泪液膜的破坏，同时由于角膜上皮瓣形成以后，可能对角膜瓣下的三叉神经末梢造成损伤，而导致干眼症；

2、屈光回退：即近视治疗手术一段时间后，患者的近视度数又开始增长，主要是由于患者未改变不良的用眼习惯。屈光回退是激光近视手术每个患者均需面临的问题，在进行激光手术后，患者需要爱护用眼，恢复良好的用眼习惯；

3、角膜转位撕脱：是较严重的术后后遗症，患者进行全飞秒手术或准分子激光、LASIK手术时一般会进行角膜瓣的制作，个别患者可能发生转位撕脱，主要与患者术后揉眼和愈合不良有关。