干扰素治疗HPV感染以30天为一疗程。一般做完30次以后，需及时检测明确HPV是否转阴，转为阴性后即可停止治疗。但如果检测发现HPV没有转阴，很可能需要开始第二个疗程，即60天，但通常没有具体的限制时间。所以需要根据HPV检测情况判断到底是用30天还是60天。

目前HPV治疗以干扰素治疗为主，但应用干扰素进行治疗会出现不良反应，常见不良反应包括发烧、乏力、浑身不适。所以大部分患者不愿意长时间应用干扰素，但是应用干扰素进行治疗时仍需坚持足够的时间。