如果是肛周脓肿自动破溃通常不会自愈，因为肛周脓肿破溃的破口太小，不足以完全引流，其中的脓液仍存在。虽然破溃后有脓液流出，但只是较小一部分，而且破溃的小孔会较快愈合，大概需要1天时间。因此即使肛周脓肿破溃流脓，通常也不会自愈。

临床中要求肛周脓肿的切口要与脓肿直径相适应，如脓肿部分直径为1cm，则切口也要尽量达到1cm。其目的是让纱条放入，以保证引流通畅。对于医生来说引流通畅最为关键，要将肛周脓肿底部的脓液引流出，引流以及换药时均要求纱条放至底部。