冠状动脉搭桥手术分为心脏停跳下体外循环下的手术和心脏不停跳非体外循环下的手术，传统的冠状动脉搭桥手术是在体外循环心脏停跳下完成，优点为心脏在相对静止、无血的状态下便于术者进行吻合，将吻合口做的很精细。缺点是体外循环本身因为是非自然状态，可能会对患者造成副损伤，影响肝肾功能、神经系统、栓子等。

另一种方法是在心脏跳动下不利用体外循环机，在心脏跳动下完成手术，使用特殊的器械，比如心脏稳定器、吹管、动脉分流栓等器具完成。优点为心脏一直处在跳动状态下，不需要心脏停跳，一直维持一种生理状态，减少对心脏和其他器官的影响，但是缺点是因为有些病变在比较高的位置，需要搬动心脏比较大，可能会影响血流动力学，需要麻醉师跟术者很好的配合完成手术。