睡醒肚子疼即腹痛的主要原因有以下几点：

1、膀胱充盈：睡醒之后尿液储存在膀胱内，膀胱充盈时可能受到一定的张力，导致一定的压力而引起腹痛，通常解完小便后一段时间会有所好转；

2、腹部受凉：可能睡觉时腹部受凉，对于肠管容易激惹的人群，受凉容易引起小肠的痉挛性收缩，导致疼痛，可能在腹部温暖后会有所好转；

3、肠功能可能紊乱：如自主神经功能紊乱导致肠功能紊乱，此时容易出现不正常的收缩，也会引起腹痛。通常给予纠正肠功能紊乱的药物，如得舒特(匹维溴铵片)、援生力维(马来酸曲美布汀片)和益生菌等，通常能得到一定的缓解；

4、器质性疾病：少数器质性病变，如结肠或直肠肿瘤，或小肠炎症、肿瘤等，通常通过结肠镜检查和腹腔的肠管造影等，可以判断是否存在此类疾病。